LINE-Retrotranspositions-Phylogenie der Vögel (Aves)

Basic data for this project

Type of projectIndividual project
Duration at the University of Münster01/08/2009 - 30/04/2013

Description

Die Verwandtschaftsbeziehungen zwischen Vogelordnungen sind bis heute zu wei­ten Teilen ungeklärt. So gibt es zahlreiche auf Morphologie oder molekularen Methoden beruhende Analysen, die einander in vielen Punkten widersprechen. Diese Widersprüche kommen durch Homoplasien im Datensatz zustande, also Merkmale, die sekundär verloren oder unabhängig erworben wurden und damit zu fehlerhaften Ergebnissen führen. Im hier beantragten Projekt möchten wir die un­gelösten Fragen des Vogel-Stammbaums anhand „springender Gene“ lösen, die einmal in einem gemeinsamen Vorfahren im Genom inseriert, die Zusammengehörigkeit abstammender Arten belegen. Verfügbare genomische Sequenzen von Zebrafink und Kondor sowie von uns partiell sequenzierte Genome von Haustaube und Kormoran sollen bioinformatisch analysiert werden. Die informativen Genorte werden dann in einem breiten Artenspekt­rum experimentell analysiert. In umfangreichen Vorarbeiten zu dem hier be­antragten Projekt konnten wir bereits diverse Verzweigungen durch „springende Gene“ definieren. Dies zeigt, dass mit dieser Methode die Klärung tiefer ebenso wie junger Äste des Vogel-Stammbaumes ein realisierbares Ziel ist.

KeywordsAves; retroposon phylogenomic
Funding identifierSCHM 1469/4-1
Funder / funding scheme
  • DFG - Individual Grants Programme

Project management at the University of Münster

Schmitz, Jürgen
Institute of Experimental Pathology

Applicants from the University of Münster

Schmitz, Jürgen
Institute of Experimental Pathology