Infrastructures and Practices for Reproducible Research in Geography, Geosciences, and GIScience

Grunddaten zum Promotionsverfahren

Promotionsverfahren erfolgt(e) an: Promotionsverfahren an der Universität Münster
Zeitraum04.01.2016 - 14.02.2022
Statusabgeschlossen
Promovend*inNüst, Daniel
PromotionsfachGraduate School for Geoinformatics
AbschlussgradDr. rer. nat.
Verleihender FachbereichFachbereich 14 - Geowissenschaften
Betreuer*innenPebesma, Edzer

Beschreibung

Die Reproduzierbarkeit von rechnergestützter Forschung stellt alle Wissenschaftszweigevor enorme Herausforderungen. In dieser Dissertation werden Technologien und Praktiken entwickelt, um die Reproduzierbarkeit zu erhöhen und sie besser mit dem Prozess derwissenschaftlichen Kommunikation zu verbinden, mit besonderem Fokus auf Geographie, Geowissenschaften und GIScience. Basierend auf Containerisierung wird in dieser Arbeiteine Plattform geschaffen, die bestehende akademische Infrastrukturen mit einem neuartigen ausführbarem Forschungskompendium (Executable Research Compendium; ERC) verbindet. Es wird gezeigt, dass das ERC die Transparenz, Verständlichkeit, Reproduzierbarkeit und Wiederverwendbarkeit von Forschungsergebnissen, zum Beispiel für Peer-Reviews, verbessert,indem es alle Teile eines computergestützten Arbeitsablaufs erfasst. Das Kernstück der ERC-Plattform ist eine Software, welche die Rechenumgebung automatisch erfassen kann, so dass die Autoren nur noch sogenannte computational notebooks, digitale Notizbücher die Text und Analysecode verbinden, erstellen müssen. Die Arbeit untersucht weiter, wie Containerisierung unabhängig von ERCs angewendet wird und werden kann, unter anderem bei einer komplexen Analyse aus der Fernerkundung, für Datenwissenschaften im Allgemeinen sowie innerhalb der Anwenderschaft der Programmiersprache R. Basierend auf diesen technischen Grundlagenkommt die Arbeit zu dem Schluss, dass es funktionierende praktische Lösungen gibt, die Reproduzierbarkeit durch geeignete Infrastruktur möglich machen und die Benutzung deutlichvereinfachen. Mehrere nachgelagerte Anwendungen, die auf ERCs aufbauen, bieten neuartige Möglichkeiten, die nächste Generation von Publikationen besser suchen und inspizieren zukönnen. Um zu verstehen, warum reproduzierbare Forschung nicht weit verbreitet ist, und um zur Verbreitung reproduzierbarer Forschungspraktiken beizutragen, untersucht die Dissertation weiterhin den Stand der Reproduzierbarkeit in der wissenschaftlichen Disziplin GIScience. Sie entwickelt und demonstriert Arbeitsabläufe, mit welchen die Durchführung von rechnerischen Analysenbesser in Peer-Review-Verfahren integriert werden können. Es werden Empfehlungen gegeben, wie reproduzierbare Forschung in Peer-Review-Verfahren (wieder) eingeführt werden kann und wie Praktiken um die höchstmögliche Reproduzierbarkeit zu erreichen in der Wissenschaft normativ, lohnend und letztlich verpflichtend werden können. Diese Empfehlungen stützen sich auf über 100 als irreproduzierbar befundenen Artikeln aus der GIScience, auf die Erfahrungen aus über 30 erfolgreichen Reproduktionen von computerbasierten Arbeitsabläufen in verschiedenen Wissenschaftsbereichen und auf die Erkenntnisse von der Implementierung des ERC. Neben der Weiterentwicklung der eingebrachten Konzepte und der Infrastruktur weist die Dissertation auf weitergehende Themen zukünftiger Arbeit hin, wie zum Beispiel die Untersuchung von Prozessen für Code-Ausführung als Teil von Begutachtungen von Manuskripten, oder Reproduktions- und Replikationsstudien für grundlegende Arbeiten in den betrachteten Wissenschaftsdisziplinen. Die technischen und sozialen Barrieren für höhere Reproduzierbarkeit sind stark mit anderen Transformationsprozessen in der Wissenschaft verwoben und daher trifft die Verbesserung der Reproduzierbarkeit auf ähnliche Herausforderungen rund um Kulturwandel und Nachhaltigkeit. Die Arbeit zeigt jedoch klar, dass reproduzierbare Forschung jedoch schon heute auf Basis der neu entwickelten Infrastrukturen und Praktiken realisierbar ist. Die Übertragbarkeit von disziplinübergreifenden Erkenntnissen begünstigt dieEtablierung reproduzierbarer Forschungspraktiken, und mehr als andere Transformationen kann die Bewegung hin zu mehr Reproduzierbarkeit aus zugänglichen und überzeugenden Argumenten sowohl für einzelne Forscher als auch für ihre Gemeinschaften schöpfen.

Promovend*in an der Universität Münster

Nüst, Daniel
Professur für Geoinformatik (Prof. Pebesma)

Betreuung an der Universität Münster

Pebesma, Edzer
Professur für Geoinformatik (Prof. Pebesma)

Projekte in denen das Promotionsverfahren erfolgt(e)

Laufzeit: 01.03.2019 - 31.07.2021 | 2. Förderperiode
Gefördert durch: DFG - Wissenschaftliche Literaturversorgung und Informationssysteme
Art des Projekts: Gefördertes Einzelprojekt
Laufzeit: 01.11.2015 - 31.12.2018 | 1. Förderperiode
Gefördert durch: DFG - Wissenschaftliche Literaturversorgung und Informationssysteme
Art des Projekts: Gefördertes Einzelprojekt

Publikationen im Promotionsverfahren entstanden

Nüst, Daniel (2022)
Münster: Selbstverlag / Eigenverlag.
Art der Publikation: Qualifikationsschrift (Dissertation, Habilitationsschrift)
Nüst Daniel, Eglen Stephen J. (2021)
Art der Publikation: Sonstige wissenschaftliche Veröffentlichung
Nüst, Daniel (2021)
Art der Publikation: Sonstige wissenschaftliche Veröffentlichung
Hauschke Christian; Nüst Daniel; Cordts Anette; Lilienthal Svantje (2021)
Art der Publikation: Sonstige wissenschaftliche Veröffentlichung
Ostermann FO, Nüst D, Granell C, Hofer B, Konkol M (2021)
In: Janowicz K, Verstegen JA (Hrsg.), 11th International Conference on Geographic Information Science (GIScience 2021) - Part II. Dagstuhl, Germany: Dagstuhl Publishing.
Art der Publikation: Forschungsartikel in Sammelband (Konferenz)

Preisverleihungen erhalten für Promotion

GIScience 2021 Award for Best Paper
Verliehen von: GIScience Organising Committee
Verliehen an: Ostermann, Frank; Nüst, Daniel; Granell, Carlos; Hofer, Barbara; Konkol, Markus
Bekannt gegeben am: 30.09.2021 | Verleihung erfolgte am: 01.01.2021
Art der Preisverleihung: Preis für beste Veröffentlichung