BMBF Verbundprojekt FBI ZOO - IP16: Von den Daten zum Wissen: Data-Warehouse für lebensmittelbedingte zoonotische Infektionen

Basic data for this project

Description

Das individuelle Projekt (IP) 16 „Von den Daten zum Wissen: Data-Warehouse für lebensmittelbedingte zoonotische Infektionen" adressiert das „Work Package" 7 vom FBI-Zoo Gesamtprojekt und interagiert mit fast allen anderen Projektteilnehmern. IP 16 ist vorgesehen als das zentrale Datenarchiv vom Gesamtprojekt. In diesem Archiv sollen mit modernen Techniken (z.B. sequenzbasiert und MLVA) generierte Typisierungsdaten als auch detaillierte epidemiologische Daten aus der Human- und Veterinärmedizin gespeichert werden. Die so erhobenen und gesammelten Daten formen wiederum die Basis für zukünftige fortgeschrittene „data mining" Techniken, wie z.B. Frühwarn- und geographische Informationssysteme (GIS). IP 16 steht daher beispielhaft für einen Übergang von den Daten zum Wissen in der epidemiologischen Surveillance. Es wird ein Client/Server System mit Nutzer-Authentifizierung und verschiedenen Rollen zur Speicherung und Analyse von Sequenzdaten (SLST, MLST) implementiert. Als nächstes soll das Client/Server System erweitert werden, um auch epidemiologische Daten adäquat sammeln und berichten zu können. Darauf folgt die Implementierung zum Speichern und Analysieren von binären/kategorischen Daten (z.B. MLVA, SNPs oder Patho-Chip-Daten). Weiterhin soll eine international akzeptierte und vereinbarte Programmierungsschnittstelle (API) zum Befragen und zur Dateneingabe bei solchen Systemen entworfen und realisiert werden.