Does pre-incubation in selective-enrichment media improve the detection of diarrheagenic Escherichia coli using the RIDA®GENE PCR?

Froböse N.J.; Olaru I.D.; Schneider J.S.; Zhang W.; Mellmann A.; Schuler F.; Grebe T.; Schaumburg F.

Forschungsartikel (Zeitschrift) | Peer reviewed

Zusammenfassung

We aimed to investigate whether a selective pre-PCR enrichment step improves test performance of RIDA®GENE EHEC/EPEC to detect diarrheagenic Escherichia coli from stool samples. Each of the 250 stool samples was analyzed for the presence of stx1/2 and eae both with and without pre-PCR enrichment in selective broth. In comparison to a reference method, sensitivities for stx1/2 and eae with and without pre-PCR enrichment were 84% (95%CI 70–93) and 89% (stx1/2, 95%CI 76–96), and 71% (95%CI 58–81) and 72% (eae, 95%CI 60–82), respectively. Specificity exceeded 97% for both methods and target genes. In summary, pre-PCR broth enrichment did not improve test performance.

Details zur Publikation

FachzeitschriftInternational Journal of Medical Microbiology (Int J Med Microbiol)
Jahrgang / Bandnr. / Volume313
Ausgabe / Heftnr. / Issue2
Seitenbereich151575-151575
StatusVeröffentlicht
Veröffentlichungsjahr2023 (31.01.2023)
Sprache, in der die Publikation verfasst istEnglisch
DOI10.1016/j.ijmm.2023.151575
Link zum Volltexthttps://api.elsevier.com/content/abstract/scopus_id/85149786731
StichwörterCulture; Enteropathogenic Escherichia coli; Enrichment, polymerase chain reaction; Enterohemorrhagic Escherichia coli

Autor*innen der Universität Münster

Froböse, Neele Judith
Institut für Medizinische Mikrobiologie
Grebe, Tobias
Institut für Medizinische Mikrobiologie
Mellmann, Alexander
Institut für Hygiene
Olaru, Ioana Diana
Institut für Medizinische Mikrobiologie
Schaumburg, Frieder
Institut für Medizinische Mikrobiologie
Schneider, Julia Sophie
Institut für Hygiene
Schuler, Franziska Dorothee
Institut für Medizinische Mikrobiologie