A dinuclear silver(I)-mediated base pair in DNA formed from 1,N6-ethenoadenine and thymine

Mandal S, Hebenbrock M, Müller J

Forschungsartikel (Zeitschrift) | Peer reviewed

Zusammenfassung

The artificial nucleobase 1,N 6-ethenoadenine (εA) is shown to form a dinuclear Ag(I)-mediated base pair with a complementary thymine (T) residue in double-helical DNA. The stabilizing effect brought about by the formation of such a metal-mediated base pair amounts to 5-6°C. It does not depend on the orientation of the base pair within the duplex, i.e. the εA-Ag(I)2-T base pair confers the same stability as the T-Ag(I)2-εA base pair. Circular dichroism studies and temperature-dependent UV spectroscopy were applied to establish the formation of this Ag(I)-mediated base pair. Based on DFT calculations, a base pair configuration is proposed in which one Ag(I) ion is coordinated by εA-N6 and T-O4, whereas the other Ag(I) ion forms coordinate bonds to εA-N7 and T-N3. The computations indicate a short intramolecular Ag⋯Ag contact of 2.87Å, suggesting that argentophilic interactions may be involved.

Details zur Publikation

FachzeitschriftInorganica Chimica Acta
Jahrgang / Bandnr. / Volume472
Seitenbereich229-233
StatusVeröffentlicht
Veröffentlichungsjahr2018 (31.05.2017)
Sprache, in der die Publikation verfasst istEnglisch
DOI10.1016/j.ica.2017.05.072
Link zum Volltexthttps://www.scopus.com/inward/record.uri?partnerID=HzOxMe3b&scp=85020304593&origin=inward
StichwörterBioinorganic chemistry; Metal-mediated base pair; Nucleic acids; Silver

Autor*innen der Universität Münster

Hebenbrock, Marian
Professur für Anorganische Chemie (Prof. Müller)
Mandal, Soham
Professur für Anorganische Chemie (Prof. Müller)
Müller, Jens
Professur für Anorganische Chemie (Prof. Müller)

Projekte, aus denen die Publikation entstanden ist

Laufzeit: 01.01.2010 - 31.12.2017 | 2. Förderperiode
Gefördert durch: DFG - Sonderforschungsbereich
Art des Projekts: Teilprojekt in DFG-Verbund koordiniert an der Universität Münster

Promotionen, aus denen die Publikation resultiert

Metal-Mediated Base Pairs with Ethenoadenine, a Versatile Nucleobase Surrogate
Promovend*in: Mandal, Soham | Betreuer*innen: Müller, Jens
Zeitraum: 08.10.2012 - 16.08.2016
Promotionsverfahren erfolgt(e) an: Promotionsverfahren an der Universität Münster