ERA-NET PathoGenoMics 2: Identifikation von hochvariablen Genen und Genregionen in Shiga Toxin-produzierenden Escherichia coli

Grunddaten zu diesem Projekt

Beschreibung

Escherichia coli zählt zur Normalflora des menschlichen Darms. Durch Aufnahme verschiedener Virulenzfaktoren (z.B. Shiga Toxine) haben sich zahlreiche E. coli zu pathogenen Erregern entwickelt. Hierzu zählen Shiga Toxin-produzierende enterohämorrhagische E. coli (EHEC) als Erreger einer hämorrhagischen Kolitis und des hämolytisch-urämischen Syndroms. In diesem Projekt werden EHEC hinsichtlich ihrer Phylogenie, Virulenz und Regulation charakterisiert. Nach Etablierung einer Stammkollektion gemeinsam mit den Projektpartnern werden Virulenztypisierungen und Untersuchungen zur Virulenzregulation durchgeführt. Dazu werden zunächst hochvariable Gene und Genregionen hinsichtlich ihrer Phylogenie charakterisiert und die Ergebnisse anschließend mit den Resultaten der Funktionsanalysen verglichen. Durch die genotypischen Analysen werden neue Zielregionen für diagnostische und epidemiologische Fragestellungen definiert. Zudem werden die Ergebnisse der Virulenzgencharakterisierung sowie ihrer Regulation und Evolution neue infektionsbiologische Erkenntnisse zur EHEC-Pathogenese liefern. Auf der Grundlage dieses Erkenntnisgewinns können neue Wege in der Prävention und Therapie beschritten werden.