SFB 858 - B13: Molekulare Grundlagen der kooperativen Wirkungsweise der Helikase- und der Topoisomerase-Domänen in reverser Gyrase während der positiven Superspiralisierung von DNA

Grunddaten zu diesem Projekt

Beschreibung

Die DNA-Topoisomerase reverse Gyrase besteht aus einer Helikase- und einer Topoisomerase-Domäne, deren Kooperation die neuartige Funktion der positiven DNA-Superspiralisierung ermöglicht. In der tRNA-Acetylase TmcA arbeitet eine Helikase-Domäne eng mit einer Transacetylase-Domäne zusammen. Wir werden die Kooperativität der DNA-Erkennung durch reverse Gyrase mittels Quervernetzung und Massenspektrometrie sowie Röntenstrukturanalyse untersuchen, und konzertierte Konformationsänderungen im katalytischen Zyklus mit Einzelmolekül-FRET verfolgen. Weiterhin werden wir die Kooperativität in Ligandenbindung und Konformationsänderungen im katalytischen Zyklus von TmcA analysieren. Ziel ist es, die molekulare Basis der funktionellen Kooperation von Helikase-Domänen mit anderen enzymatischen Domänen zu entschlüsseln.