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Publikationen

msiFlow: automated workflows for reproducible and scalable multimodal mass spectrometry imaging and microscopy data analysis. Spangenberg P; Bessler S; Widera L; Bottek J; Richter M; Thiebes S; Siemes D; Krauß SD; Migas LG; Kasarla SS; Phapale P; Kleesiek J; Führer D; Moeller LC; Heuer H; Van de Plas R; Gunzer M; Soehnlein O; Soltwisch J; Shevchuk O; Dreisewerd K; Engel DR (2025) In: Nature Communications, 16(1), 1065-1065. doi:10.1038/s41467-024-55306-7 Forschungsartikel (Zeitschrift) \| Peer reviewed \| Veröffentlicht
Spatial biology using single-cell mass spectrometry imaging and integrated microscopy Potthoff A.; Schwenzfeier J.; Niehaus M.; Bessler S.; Hoffmann E.; Soehnlein O.; Höhndorf J.; Dreisewerd K.; Soltwisch J. (2025) In: Nature Communications, 16(1), 9129-9129. doi:10.1038/s41467-025-64603-8 Forschungsartikel (Zeitschrift) \| Peer reviewed \| Veröffentlicht
A 4-lineage Statistical Suite to Evaluate the Support of Large-Scale Retrotransposon Insertion Data to Reconstruct Evolutionary Trees Churakov, Gennady; Kuritzin, Andrej; Chukharev, Konstantin; Zhang, Fengjun; Wünnemann, Florian; Ulyantsev, Vladimir; Schmitz, Jürgen (2023) In: Systematic Biology, 72(3), 649-661. doi:10.1093/sysbio/syac082 Forschungsartikel (Zeitschrift) \| Peer reviewed \| Veröffentlicht
Homoplasy of Retrotransposon Insertions in Toothed Whales Doronina, Liliya; Ogoniak, Lynn; Schmitz, Jürgen (2023) In: Genes, 14(1830). doi:10.3390/genes14091830 Forschungsartikel (Zeitschrift) \| Peer reviewed \| Veröffentlicht
paPAML: An Improved Computational Tool to Explore Selection Pressure on Protein-Coding Sequences Steffen, R.; Ogoniak, L.; Grundmann, N.; Pawluchin, A.; Soehnlein, O.; Schmitz, J (2022) In: Genes, 2022. doi:10.3390/genes13061090 Forschungsartikel (Zeitschrift) \| Peer reviewed \| Veröffentlicht
Reunion of Australasian Possums by Shared SINE Insertions Doronina, Liliya; Feigin, Charles Y.; Schmitz, Jürgen (2022) In: Systematic Biology, 71(5), 1045-1053. doi:10.1093/sysbio/syac025 Forschungsartikel (Zeitschrift) \| Peer reviewed \| Veröffentlicht
ExoPLOT: Representation of alternative splicing in human tissues and developmental stages with transposed element (TE) involvement Zhang, Fengjun; Raabe, Carsten Alexander; Cardoso-Moreiera, Margarida; Brosius, Jürgen; Kaessmann, Henrik; Schmitz, Jürgen (2022) In: Genomics, 114, 110434. Forschungsartikel (Zeitschrift) \| Peer reviewed \| Veröffentlicht
Contradictory Phylogenetic Signals in the Laurasiatheria Anomaly Zone Doronina, Liliya Hughes, Graham M. Moreno‐Santillan, Diana Lawless, Colleen Lonergan, Tadhg Ryan, Louise Jebb, David Kirilenko, Bogdan M. Korstian, Jennifer M. Dávalos, Liliana M. Vernes, Sonja C. Myers, Eugene W. Teeling, Emma C. Hiller, Michael Jermiin, Lars S. Schmitz, Jürgen Springer, Mark S. Ray, David A. (2022) In: Genes, 13(766). doi:10.3390/genes13050766 Forschungsartikel (Zeitschrift) \| Peer reviewed \| Veröffentlicht
Euarchontoglires Challenged by Incomplete Lineage Sorting Doronina, Liliya Reising, Olga Clawson, Hiram Churakov, Gennady Schmitz, Jürgen (2022) In: Genes, 13(774). doi:10.3390/genes13050774 Forschungsartikel (Zeitschrift) \| Peer reviewed \| Veröffentlicht
Behavioural immune landscapes of inflammation Crainiciuc, Georgiana; Palomino-Segura, Miguel; Molina-Moreno, Miguel; Sicilia, Jon; Aragones, David G.; Li, Jackson Liang Yao; Madurga, Rodrigo; Adrover, Jose M.; Aroca-Crevillen, Alejandra; Martin-Salamanca, Sandra; Serrano del Valle, Alfonso; Castillo, Sandra D.; Welch, Heidi C. E.; Soehnlein, Oliver; Graupera, Mariona; Sanchez-Cabo, Fatima; Zarbock, Alexander; Smithgall, Thomas E.; Di Pilato, Mauro; Mempel, Thorsten R.; Tharaux, Pierre-Louis; Gonzalez, Santiago F.; Ayuso-Sacido, Angel; Ng, Lai Guan; Calvo, Gabriel F.; Gonzalez-Diaz, Ivan; Diaz-de-Maria, Fernando; Hidalgo, Andres (2022) In: Nature, 601, 415-421. doi:10.1038/s41586-021-04263-y Forschungsartikel (Zeitschrift) \| Peer reviewed \| Veröffentlicht