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Harmsen, Dag

The dark matter of bacterial genomic surveillance-antimicrobial resistance plasmid transmissions in the hospital setting Sobkowiak A; Schwierzeck V; van Almsick V; Scherff N; Schuler F; Bessonov K; Robertson J; Harmsen D; Mellmann A (2025) In: Journal of Clinical Microbiology, 63(6). doi:10.1128/jcm.00121-25 Forschungsartikel (Zeitschrift) \| Peer reviewed \| Veröffentlicht
[Assessment of available and currently applied typing methods of zoonotic pathogens using the example of Shiga toxin-producing and enterohemorrhagic Escherichia coli (STEC/EHEC)]. Richter A; Pietsch M; Harmsen D; Juraschek K; Lang C; Mellmann A; Middendorf-Bauchart B; Pulz M; Roth S; Schuh E; Fruth A; Flieger A (2023) In: Bundesgesundheitsblatt - Gesundheitsforschung - Gesundheitsschutz, 66(1), 84-91. doi:10.1007/s00103-022-03628-6 Forschungsartikel (Zeitschrift) \| Peer reviewed \| Veröffentlicht
Multicenter Preparedness Exercise Enables Rapid Development of Cluster-Specific PCR-Based Screening Assays from Bacterial Genomic Data Treffon J.; Prior K.; Dreesman J.; Egelkamp R.; Flieger A.; Middendorf-Bauchart B.; Projahn M.; Richter A.; Schuh E.; Harmsen D.; Mellmann A. (2023) In: Journal of Clinical Microbiology, 61(3), e0187322-e0187322. doi:10.1128/jcm.01873-22 Forschungsartikel (Zeitschrift) \| Peer reviewed \| Veröffentlicht
Gut microbiome and plasma metabolome changes in rats after oral gavage of nanoparticles: sensitive indicators of possible adverse health effects. Landsiedel R, Hahn D, Ossig R, Ritz S, Sauer L, Buesen R, Rehm S, Wohlleben W, Groeters S, Strauss V, Sperber S, Wami H, Dobrindt U, Prior K, Harmsen D, Schnekenburger J, van Ravenzwaay B (2022) In: Particle and Fibre Toxicology, 19(1), 21-21. doi:10.1186/s12989-022-00459-w Forschungsartikel (Zeitschrift) \| Peer reviewed \| Veröffentlicht
Development and Evaluation of a Core Genome Multilocus Sequencing Typing (cgMLST) Scheme for Serratia marcescens Molecular Surveillance and Outbreak Investigations. Kampmeier S; Prior K; Cunningham SA; Goyal A; Harmsen D; Patel R; Mellmann A (2022) In: Journal of Clinical Microbiology, 60(11), e0119622-e0119622. doi:10.1128/jcm.01196-22 Forschungsartikel (Zeitschrift) \| Peer reviewed \| Veröffentlicht
Establishment and evaluation of a core genome multilocus sequence typing scheme for whole-genome sequence-based typing of Pseudomonas aeruginosa In: . \| Peer reviewed
Defining and Evaluating a Core Genome Multilocus Sequence Typing Scheme for Genome-Wide Typing of Clostridium difficile In: . \| Peer reviewed
High interlaboratory reproducibility and accuracy of next-generation-sequencing-based bacterial genotyping in a ring trial In: , -. \| Peer reviewed
State-wide surveillance of antibiotic resistance patterns and spa types of methicillin-resistant Staphylococcus aureus from blood cultures in North Rhine-Westphalia, 2011-2013 In: , -. \| Peer reviewed
Ensuring backwards compatibility: Traditional genotyping efforts in the era of whole genome sequencing In: , -. \| Peer reviewed

Tönnies H, Prior K, Harmsen D, Mellmann A

(2020)

((Bitte Journal prüfen))

, 59

(3)

doi:10.1128/JCM.01987-20

Forschungsartikel (Zeitschrift)

| Veröffentlicht

Bletz S, Janezic S, Harmsen D, Rupnik M, Mellmann A

(2018)

((Bitte Journal prüfen))

, 56

(6)

doi:10.1128/JCM.01987-17

Forschungsartikel (Zeitschrift)

| Veröffentlicht

Mellmann A., Andersen P., Bletz S., Friedrich A., Kohl T., Lilje B., Niemann S., Prior K., Rossen J., Harmsen D.

(2017)

Journal of Clinical Microbiology

, 55

(3)

908

913

doi:10.1128/JCM.02242-16

Forschungsartikel (Zeitschrift)

| Veröffentlicht

Cuny C., Layer F., Werner G., Harmsen D., Daniels-Haardt I., Jurke A., Mellmann A., Witte W., Köck R.

(2015)

Clinical microbiology and infection: the official publication of the European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases

, 21

(8)

750

757

doi:10.1016/j.cmi.2015.02.013

Forschungsartikel (Zeitschrift)

| Veröffentlicht

Bletz S., Mellmann A., Rothgänger J., Harmsen D.

(2015)

Clinical microbiology and infection: the official publication of the European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases

, 21

(4)

347.e1

347.e4

doi:10.1016/j.cmi.2014.11.005

Forschungsartikel (Zeitschrift)

| Veröffentlicht

The dark matter of bacterial genomic surveillance-antimicrobial resistance plasmid transmissions in the hospital setting Sobkowiak A; Schwierzeck V; van Almsick V; Scherff N; Schuler F; Bessonov K; Robertson J; Harmsen D; Mellmann A (2025) In: Journal of Clinical Microbiology, 63(6). doi:10.1128/jcm.00121-25 Forschungsartikel (Zeitschrift) \| Peer reviewed \| Veröffentlicht
[Assessment of available and currently applied typing methods of zoonotic pathogens using the example of Shiga toxin-producing and enterohemorrhagic Escherichia coli (STEC/EHEC)]. Richter A; Pietsch M; Harmsen D; Juraschek K; Lang C; Mellmann A; Middendorf-Bauchart B; Pulz M; Roth S; Schuh E; Fruth A; Flieger A (2023) In: Bundesgesundheitsblatt - Gesundheitsforschung - Gesundheitsschutz, 66(1), 84-91. doi:10.1007/s00103-022-03628-6 Forschungsartikel (Zeitschrift) \| Peer reviewed \| Veröffentlicht
Multicenter Preparedness Exercise Enables Rapid Development of Cluster-Specific PCR-Based Screening Assays from Bacterial Genomic Data Treffon J.; Prior K.; Dreesman J.; Egelkamp R.; Flieger A.; Middendorf-Bauchart B.; Projahn M.; Richter A.; Schuh E.; Harmsen D.; Mellmann A. (2023) In: Journal of Clinical Microbiology, 61(3), e0187322-e0187322. doi:10.1128/jcm.01873-22 Forschungsartikel (Zeitschrift) \| Peer reviewed \| Veröffentlicht
Gut microbiome and plasma metabolome changes in rats after oral gavage of nanoparticles: sensitive indicators of possible adverse health effects. Landsiedel R, Hahn D, Ossig R, Ritz S, Sauer L, Buesen R, Rehm S, Wohlleben W, Groeters S, Strauss V, Sperber S, Wami H, Dobrindt U, Prior K, Harmsen D, Schnekenburger J, van Ravenzwaay B (2022) In: Particle and Fibre Toxicology, 19(1), 21-21. doi:10.1186/s12989-022-00459-w Forschungsartikel (Zeitschrift) \| Peer reviewed \| Veröffentlicht
Development and Evaluation of a Core Genome Multilocus Sequencing Typing (cgMLST) Scheme for Serratia marcescens Molecular Surveillance and Outbreak Investigations. Kampmeier S; Prior K; Cunningham SA; Goyal A; Harmsen D; Patel R; Mellmann A (2022) In: Journal of Clinical Microbiology, 60(11), e0119622-e0119622. doi:10.1128/jcm.01196-22 Forschungsartikel (Zeitschrift) \| Peer reviewed \| Veröffentlicht
Establishment and evaluation of a core genome multilocus sequence typing scheme for whole-genome sequence-based typing of Pseudomonas aeruginosa In: . \| Peer reviewed
Defining and Evaluating a Core Genome Multilocus Sequence Typing Scheme for Genome-Wide Typing of Clostridium difficile In: . \| Peer reviewed
High interlaboratory reproducibility and accuracy of next-generation-sequencing-based bacterial genotyping in a ring trial In: , -. \| Peer reviewed
State-wide surveillance of antibiotic resistance patterns and spa types of methicillin-resistant Staphylococcus aureus from blood cultures in North Rhine-Westphalia, 2011-2013 In: , -. \| Peer reviewed
Ensuring backwards compatibility: Traditional genotyping efforts in the era of whole genome sequencing In: , -. \| Peer reviewed